Добрый день.
Цитата: Попадет ли начисленная компенсация в 1 раздел 6-НДФЛ?
Компенсация за неиспользованный отпуск? Не попадает ни в одну из строк.
Цитата: 3.Исчисление сумм налога производитсяналоговыми агентамина дату фактического получения дохода, определяемую в соответствии со статьей 223настоящего Кодекса, нарастающим итогом с начала налогового периода применительно ко всем доходам (за исключением доходов от долевого участия в организации, а также доходов, в отношении которых исчисление сумм налога производится в соответствии со статьей 214.7 настоящего Кодекса), в отношении которых применяется налоговая ставка, установленная пунктом 1 статьи 224 настоящего Кодекса, начисленным налогоплательщику за данный период, с зачетом удержанной в предыдущие месяцы текущего налогового периода суммы налога.
Для КНО дата фактического получения дохода - дата выплаты (п. 1 ст. 223 НК). Нет выплаты - нет дохода, нет исчисленного НДФЛ.
Цитата: Скорее всего у налоговой возникнет вопрос по этой ситуации: будет расхождение баз с РСВ, 6-НДФЛ
Будет. Но это довольно частое явление, просто поясните.
Цитата: будет расхождение баз ... 6-НДФЛ и 2-НДФЛ.
Не будет. В справку 2-НДФЛ за 2019 год этот доход тоже не попадёт.